慢性肠炎的症状主要表现为长期慢性、或反复发作的腹痛、腹泻及消化不良等,重者可有黏液便或水样便。腹泻程度轻重不一,轻者每日排便3~4次,或腹泻便秘交替出现;
重者可每1~2小时一次,甚至出现大便失禁。部分可有夜间腹泻和(或)餐后腹泻。直肠严重受累时,可出现里急后重感。粪质多呈糊状,混有大量黏液,常带脓血等。