巧克力囊肿的治疗有药物治疗和手术治疗.一般来说对于有生育要求的还是尽量给予药物治疗的.您现在31岁,可以考虑先口服避孕药防止复发,控制病情,如果口服药物效果不好.也可以采用腹腔镜切除病变部位,还有一部分患者,年龄比较大,症状比较严重,没有生育要求,可以考虑切除病变侧的卵巢及囊肿.因为对您的病情不是特别清楚.所以还是建议您到正规医院检查后听从医生的建议。