肛瘘的治疗分为非手术治疗和手术治疗。非手术疗法主要通过药物控制感染,减轻症状,但不能完全治好,或一时相对含转,很容易复发。
手术的目的是为了清除感染的肛门腺,将瘘管内感染的异物清除,这是肛瘘的治疗的关键。