克罗恩病肠镜下表现有病变呈节段性分布,表现为纵行,表面覆盖有厚的白苔,重的表现为裂隙样,也可以表现为葡行性,但溃疡间的黏膜是正常的。
肠腔可以出现多处狭窄,有时肠镜难以通过。有些反复发作,炎症迁延不愈,可以形成很多的炎性息肉,表现为鹅卵石样外观,轻症表现为小的阿佛它溃疡或红斑。