怀孕的人染色体的异常可影响胚胎的发育,导致流产。虽有少数染色体异常胎儿能够足月分娩,但常常存在智力障碍。孕妇血液、循环、泌尿系等疾病也可能影响胚胎发育,如高热、重度贫血、急性或慢性肾炎、心力衰竭。
而生殖器官畸形尤其是子宫畸形如未能得到纠正亦会致胚胎停育。