恐怖症的原因目前尚不十分清晰,目前研究与遗传、生化和特殊的条件反射相关。恐惧症病人的神经系统的惊醒水平增高,这种人很敏感、警觉,处于过度觉醒状态。
其体内交感神经兴奋占优势,肾上腺素、甲状腺素的分泌增加。但这种生理状态与恐惧症的因果关系尚难分清。