黄体功能不全的原因主要是排卵期黄体生成素分泌不充分,卵泡期FSH分泌不足,卵泡液中促卵泡成熟素和雌二醇低值;子宫内膜细胞甾体激素受体异常,对黄体分泌的激素反应性低下,即使黄体功能正常,内膜发育不良;
黄体期黄体生成素分泌不足或其脉冲式分泌不充分;全身性疾病,因为病人营养不良或者身体虚弱也会使得女性黄体功能不全的产生。