扁桃体肥大可引起咽炎、喉炎、气管炎、肺炎;中耳炎;鼻炎、鼻窦炎、淋巴结炎等并发症。扁桃体病原体最容易引起免疫系统功能障碍和全身并发症。
如风湿热(风湿性关节炎、风湿性心脏病、皮肤病(牛皮癣、渗出性红斑多发症、心肌炎、肾炎、哮喘、糖尿病、血液病等难治性疾病。