肛瘘前期的症状有流脓味臭,色黄,以后逐渐减少,时有时无,呈现白色,质稀淡,疼痛。由于分泌物刺激,使肛门部潮湿、痒,有时会形成湿疹,当外口愈合,瘘管中有脓肿形成时,可感到明显痛,同时可伴有热寒战、乏力等全身感染症状。