磁共振是不能检查出巧克力囊肿的,因为巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症引起的。巧克力囊肿会随着月经周期逐渐增大。小的巧克力囊肿一般没有明显的自觉症状,大的巧克力囊肿会出现病变相应部位的胀痛不适,腰部酸痛,痛经等。