病情分析:您好,根据您的描述来看您在月经第三天是完全可以去医院做根管治疗术的第二次治疗,它对您身体是没有影响的。
指导意见:因为根管治疗术只是一个局部治疗方法,其只是对单颗牙齿进行切断牙髓神经的治疗手段,它分为3个主要步骤,您所说的第2步是进行根管消毒,它只是在根管里面封入消毒抗炎的药物,即换药。
请您放心好了,您月经期间去医院进行根管消毒(换药)治疗对您的身体是完全没有影响的。