你好,胃肠镜和肛肠镜的区别就在于他们看到的部位不一样,而且进入的方法不一样的,胃肠镜的话,主要使用来看胃部和十二指肠等上消化系统的,而肛肠镜主要是为了看接触以及回肠等后消化道的,所以他们看的部位是不一样的,前者是从嘴里进去的,而肛肠镜的话,是从肛门里进入的,至于你到底用什么镜子,就要看你是什么病了,如果你是怀疑自己是胃上的溃疡或者十二指肠的蹭的话,那么就使用胃肠镜,如果是因为结肠的大便不好,或者便血的话,那么建议做肛肠镜的