子宫内膜异位症之所以发生不孕、是由于异位的子宫内膜发生周期性出血、血液不能外流、刺激盆腔腹膜、发生粘连、形成疤痕、使输卵管受压梗阻;
或使输卵管浆膜粘连成束、扭曲、从而影响摄取卵子的作用;或因粘连、子宫后倾固定、使精子不易进入子宫口;或因粘连包绕卵巢、卵子排不出;
或因子宫内膜异位囊肿(又称巧克力囊肿)、异位于卵巢内的内膜病灶破坏了卵巢实质、影响排卵从而造成女性子宫内膜性不孕的发生